Η δεοξυριβόζη είναι ένας μονοσακχαρίτης 5 άνθρακα (πεντόζη) που σχηματίζεται από τη ριβόζη όταν χάνει ένα άτομο οξυγόνου. Ο εμπειρικός χημικός τύπος για τη δεοξυριβόζη είναι C5H10O4, και λόγω της απώλειας ενός άτομο οξυγόνου, δεν συμφωνεί με τον γενικό τύπο για τους μονοσακχαρίτες (CH2O) , όπου το n είναι ακέραιος αριθμός.
Φυσικές και χημικές ιδιότητες
Ο γραμμικός τύπος για τη δεοξυριβόζη μπορεί να αναπαρασταθεί ως εξής: H-(C=O)–(CH2)–(CHOH)3-H. Ωστόσο, υπάρχει επίσης με τη μορφή ενός κλειστού δακτυλίου ατόμων άνθρακα.
Η δεοξυριβόζη είναι ένα άχρωμο στερεό που είναι άοσμο και εξαιρετικά διαλυτό στο νερό. Το μοριακό του βάρος είναι 134,13 g/mol, σημείο τήξης 91 °C. Λαμβάνεται από 5-φωσφορική ριβόζη λόγω της δράσης κατάλληλων ενζύμων κατά τη διάρκεια της χημικής αντίδρασης αναγωγής.
Η διαφορά μεταξύ ριβόζης και δεοξυριβόζης
Όπως ήδη αναφέρθηκε και όπως υποδηλώνει το όνομα, η δεοξυριβόζη είναι μια χημική ένωση της οποίας η ατομική σύνθεση διαφέρει από αυτή της ριβόζης μόνο κατά ένα άτομο οξυγόνου. Οπως φαίνεταιστο παρακάτω σχήμα, η δεοξυριβόζη δεν έχει ομάδα υδροξυλίου ΟΗ στο δεύτερο άτομο άνθρακα της.
Η δεοξυριβόζη είναι μέρος της αλυσίδας του DNA (δεοξυριβονουκλεϊκό οξύ), ενώ η ριβόζη είναι μέρος της αλυσίδας RNA (ριβονουκλεϊκό οξύ).
Είναι ενδιαφέρον να σημειωθεί ότι οι μονοσακχαρίτες αραβινόζη και ριβόζη είναι στερεοϊσομερή, δηλαδή διαφέρουν στη χωρική διάταξη σε σχέση με το επίπεδο του δακτυλίου της ομάδας ΟΗ κοντά στο 2ο άτομο άνθρακα. Η δεοξυαραβινόζη και η δεοξυριβόζη είναι η ίδια ένωση, αλλά το δεύτερο όνομα χρησιμοποιείται επειδή αυτό το μόριο προέρχεται από τη ριβόζη.
Δεοξυριβόζη και γενετικές πληροφορίες
Επειδή η δεοξυριβόζη είναι μέρος της αλυσίδας του DNA, παίζει σημαντικό βιολογικό ρόλο. Το DNA - η πηγή της γενετικής πληροφορίας, αποτελείται από νουκλεοτίδια, τα οποία περιλαμβάνουν δεοξυριβόζη. Τα μόρια δεοξυριβόζης συνδέουν ένα νουκλεοτίδιο με ένα άλλο στην αλυσίδα του DNA μέσω φωσφορικών ομάδων.
Η απουσία της ομάδας υδροξυλ ΟΗ στη δεοξυριβόζη έχει βρεθεί ότι δίνει μηχανική ευελιξία σε ολόκληρη την αλυσίδα του DNA σε σύγκριση με το RNA, το οποίο με τη σειρά του επιτρέπει στο μόριο του DNA να σχηματίσει διπλό κλώνο και να είναι σε συμπαγή μορφή μέσα στο κυτταρικός πυρήνας.
Επιπλέον, λόγω της ευελιξίας των δεσμών μεταξύ των νουκλεοτιδίων που σχηματίζονται από μόρια δεοξυριβόζης και ομάδες φωσφορικών, η αλυσίδα του DNA είναι πολύ μεγαλύτερη από το RNA. Αυτό το γεγονός καθιστά δυνατή την κωδικοποίηση γενετικών πληροφοριών με υψηλή πυκνότητα.
