Kovalevskaya Sofia Vasilievna γεννήθηκε στις 3 Ιανουαρίου 1850 στη Μόσχα. Η μητέρα της ήταν η Ελίζαμπεθ Σούμπερτ. Ο πατέρας, στρατηγός του πυροβολικού Korvin-Krukovsky, τη στιγμή της γέννησης της κόρης του, υπηρέτησε ως επικεφαλής του οπλοστασίου. Όταν το κορίτσι ήταν έξι ετών, αποσύρθηκε, εγκαταστάθηκε σε ένα οικογενειακό κτήμα